MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mycobacterium sp. JDM601 chromosome

Total Repeats: 9355

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015576	GCCG	2	8	2375559	2375566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_015576	CGGC	2	8	2375579	2375586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5003	NC_015576	TCCCG	2	10	2377056	2377065	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5004	NC_015576	TGCG	2	8	2377089	2377096	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5005	NC_015576	GGC	2	6	2378704	2378709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_015576	TTC	2	6	2378811	2378816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_015576	CGG	2	6	2378858	2378863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_015576	CAT	2	6	2378933	2378938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_015576	TCT	2	6	2378955	2378960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_015576	CAC	2	6	2378992	2378997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_015576	CGC	2	6	2379011	2379016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_015576	ACG	2	6	2379039	2379044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_015576	GGCC	2	8	2379046	2379053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_015576	CGC	2	6	2380648	2380653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_015576	C	6	6	2380699	2380704	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5016	NC_015576	TCT	2	6	2380781	2380786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_015576	ACG	2	6	2380787	2380792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5018	NC_015576	GCG	2	6	2382777	2382782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_015576	CTC	2	6	2382798	2382803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5020	NC_015576	CCG	2	6	2382821	2382826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_015576	TC	3	6	2384970	2384975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_015576	CAA	2	6	2399913	2399918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_015576	GCT	2	6	2399921	2399926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_015576	CATCG	2	10	2399934	2399943	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5025	NC_015576	A	6	6	2399964	2399969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_015576	CAG	2	6	2399984	2399989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_015576	ACG	2	6	2399996	2400001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_015576	ACCC	2	8	2400008	2400015	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5029	NC_015576	CGA	2	6	2400051	2400056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_015576	CGCATC	2	12	2400063	2400074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_015576	CCG	2	6	2400083	2400088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5032	NC_015576	CA	3	6	2400116	2400121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_015576	CACC	2	8	2400146	2400153	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5034	NC_015576	CCA	2	6	2400154	2400159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5035	NC_015576	AACCCA	2	12	2400170	2400181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_015576	CCGCCA	2	12	2400212	2400223	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_015576	ATC	2	6	2400237	2400242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5038	NC_015576	ACG	2	6	2400273	2400278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_015576	C	6	6	2400285	2400290	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5040	NC_015576	CAA	2	6	2410077	2410082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_015576	GCT	2	6	2410085	2410090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_015576	CATCG	2	10	2410098	2410107	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5043	NC_015576	A	6	6	2410128	2410133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_015576	CAG	2	6	2410148	2410153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5045	NC_015576	ACG	2	6	2410160	2410165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_015576	ACCC	2	8	2410172	2410179	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5047	NC_015576	CGA	2	6	2410215	2410220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_015576	CGCATC	2	12	2410227	2410238	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_015576	CCG	2	6	2410247	2410252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_015576	CA	3	6	2410280	2410285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_015576	CACC	2	8	2410310	2410317	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5052	NC_015576	CCA	2	6	2410318	2410323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5053	NC_015576	AACCCA	2	12	2410334	2410345	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5054	NC_015576	CCGCCA	2	12	2410376	2410387	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_015576	ATC	2	6	2410401	2410406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_015576	C	6	6	2410449	2410454	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5057	NC_015576	CTCAA	2	10	2410477	2410486	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5058	NC_015576	CG	3	6	2410500	2410505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_015576	AGC	2	6	2410506	2410511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_015576	GCC	2	6	2413588	2413593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_015576	CG	3	6	2414907	2414912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_015576	TTA	2	6	2420183	2420188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_015576	ATG	2	6	2420238	2420243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_015576	GCG	2	6	2420257	2420262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_015576	CGT	2	6	2420288	2420293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_015576	GCC	2	6	2421117	2421122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_015576	GGC	2	6	2421142	2421147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_015576	GGC	2	6	2421186	2421191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_015576	GCT	2	6	2421206	2421211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_015576	ACA	2	6	2421599	2421604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_015576	CAA	2	6	2421625	2421630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5072	NC_015576	GCGG	2	8	2424487	2424494	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5073	NC_015576	CAT	2	6	2424517	2424522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_015576	GTG	2	6	2424523	2424528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_015576	GGC	2	6	2424577	2424582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_015576	CGA	2	6	2424586	2424591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5077	NC_015576	GCG	3	9	2425362	2425370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_015576	ATCGA	2	10	2428008	2428017	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5079	NC_015576	CGCTG	2	10	2428026	2428035	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5080	NC_015576	CCG	2	6	2428089	2428094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5081	NC_015576	TCC	2	6	2431288	2431293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_015576	GGTC	2	8	2431299	2431306	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5083	NC_015576	CGT	2	6	2431346	2431351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_015576	CCTC	2	8	2431408	2431415	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5085	NC_015576	CTC	2	6	2431421	2431426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_015576	CGGC	2	8	2431440	2431447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_015576	TCG	3	9	2431449	2431457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5088	NC_015576	GGC	2	6	2431458	2431463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_015576	AGC	2	6	2432128	2432133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_015576	CCG	2	6	2432180	2432185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_015576	CAG	2	6	2433632	2433637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_015576	GCG	2	6	2433638	2433643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_015576	ACA	2	6	2433674	2433679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_015576	ATC	2	6	2433808	2433813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_015576	AGCA	2	8	2433821	2433828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5096	NC_015576	CAG	2	6	2433836	2433841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_015576	AGGTG	2	10	2434430	2434439	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_015576	GC	3	6	2434479	2434484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_015576	GGA	2	6	2434507	2434512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_015576	GGC	2	6	2437367	2437372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_015576	AGC	2	6	2437374	2437379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_015576	AAG	2	6	2438192	2438197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_015576	CGT	2	6	2439893	2439898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_015576	GGT	2	6	2439899	2439904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_015576	CCG	2	6	2441194	2441199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_015576	GCA	2	6	2441206	2441211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_015576	AGCT	2	8	2441239	2441246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5108	NC_015576	GGT	2	6	2441269	2441274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_015576	CGC	2	6	2441296	2441301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_015576	CGA	2	6	2441308	2441313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_015576	GGGC	2	8	2441997	2442004	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5112	NC_015576	GCCC	2	8	2442025	2442032	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5113	NC_015576	GAC	2	6	2442125	2442130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_015576	GCGCCG	2	12	2446957	2446968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_015576	GC	3	6	2446971	2446976	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_015576	TCG	2	6	2448711	2448716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_015576	CAGTCG	2	12	2448736	2448747	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_015576	CCG	2	6	2448749	2448754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_015576	CGA	2	6	2448778	2448783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_015576	GTC	2	6	2448809	2448814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_015576	TGG	2	6	2452616	2452621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_015576	CGG	2	6	2456191	2456196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_015576	GC	3	6	2456254	2456259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_015576	TCG	2	6	2456284	2456289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_015576	GCT	2	6	2456302	2456307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_015576	CTA	2	6	2459727	2459732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_015576	GAT	2	6	2461388	2461393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_015576	C	6	6	2462395	2462400	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5129	NC_015576	CG	3	6	2462407	2462412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5130	NC_015576	ACC	2	6	2464020	2464025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_015576	CGC	3	9	2465702	2465710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_015576	GCCG	2	8	2465769	2465776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5133	NC_015576	CGGCG	3	15	2466685	2466699	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5134	NC_015576	TGA	2	6	2466718	2466723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5138	NC_015576	CTACC	2	10	2474022	2474031	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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5155	NC_015576	TCGT	2	8	2492248	2492255	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5156	NC_015576	CTCG	2	8	2492258	2492265	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5157	NC_015576	CGG	3	9	2495334	2495342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5164	NC_015576	CG	3	6	2498963	2498968	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5165	NC_015576	CGG	2	6	2499005	2499010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5252	NC_015576	ACA	2	6	2559156	2559161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5253	NC_015576	TC	3	6	2559196	2559201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5254	NC_015576	AAC	2	6	2559219	2559224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5255	NC_015576	ACT	2	6	2559251	2559256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5257	NC_015576	ACGGC	2	10	2559389	2559398	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5258	NC_015576	G	6	6	2559455	2559460	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5259	NC_015576	CTGCC	2	10	2562099	2562108	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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5261	NC_015576	CCCG	2	8	2563233	2563240	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5384	NC_015576	TGGG	2	8	2612882	2612889	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5385	NC_015576	GCCCG	2	10	2612971	2612980	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5386	NC_015576	GCC	2	6	2612981	2612986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5391	NC_015576	CGT	2	6	2613137	2613142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_015576	GCC	2	6	2613156	2613161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5395	NC_015576	GAC	2	6	2613699	2613704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5498	NC_015576	GCCCC	2	10	2665932	2665941	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5499	NC_015576	GCCCG	2	10	2665957	2665966	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5500	NC_015576	TCC	2	6	2665983	2665988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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